环状RNA测序

环状RNA（circular RNA，circRNA）呈封闭环状结构，是最近研究的热点，它大量存在于真核细胞胞质内，主要由pre-mRNA通过可变剪切加工产生，不受RNA外切酶影响，表达更稳定，不易降解。

近年的研究表明，circRNA具有重要的调控功能，例如circRNA可发挥竞争性内源RNA（ceRNA）机制，由于其分子富含microRNA（miRNA）结合位点，在细胞中起到miRNA海绵的作用，进而解除miRNA对其靶基因的抑制作用，升高靶基因的表达水平。特别是通过与疾病关联的miRNA相互作用，研究证明circRNA能影响癌症细胞的增殖、浸润与转移、血管生成以及细胞凋亡。除此以外，circRNA也具有调控其他类型RNA、调节蛋白质活性等功能。

这些特性使得circRNA具有开发疾病新型诊断与治疗方法的潜力，研究意义重大。circRNA测序的主要应用领域有肿瘤等疾病致病机理研究；生长发育过程中的基因表达调控变化；其他关心基因转录表达调控的研究方向等。

技术流程

数据分析

标准分析

• 原始数据质控

• 比对到参考基因组

• circRNA鉴定与统计：统计reads类型、circRNA类型与分布

• 来源基因富集分析

• circRNA注释

• 表达量计算与样品间表达差异分析

• 差异基因GO分析；KEGG分析

• 生物学重复样品间相关性分析

• circRNA序列预测

高级分析

• circRNA保守性分析

• circRNA、miRNA、mRNA互作分析

技术参数

样本要求

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飞凡检测质检报告流程：

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